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This is an extension of drawing Taiwan map in R

twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
dev.off()

新範例圖-tw

可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

新範例圖-自訂範圍

如何安裝

install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

以下為原始版本之介紹:

介紹

這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

原始範例圖

安裝

你可以透過 devtools 安裝

install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('mutolisp/twmap')

使用方法

library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
dev.off()

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Plot species distribution on a Taiwan map (with DTM, river, etc.)

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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Add copy buttons to all
 blocks\n(function() {\n function addCopyButtons() {\n document.querySelectorAll('pre code').forEach(function(codeBlock) {\n if (codeBlock.parentElement.hasAttribute('data-copy-added')) return;\n codeBlock.parentElement.setAttribute('data-copy-added', 'true');\n \n var btn = document.createElement('button');\n btn.textContent = 'Copy';\n btn.style.cssText = 'position:absolute;top:4px;right:4px;padding:2px 8px;font-size:11px;background:#4ecdc4;border:none;border-radius:4px;color:#1a1a2e;cursor:pointer;opacity:0.7;transition:opacity 0.2s;';\n btn.onmouseover = function() { this.style.opacity = '1'; };\n btn.onmouseout = function() { this.style.opacity = '0.7'; };\n btn.onclick = function() {\n navigator.clipboard.writeText(codeBlock.textContent).then(function() {\n btn.textContent = 'Copied!';\n setTimeout(function() { btn.textContent = 'Copy'; }, 1500);\n });\n };\n codeBlock.parentElement.style.position = 'relative';\n codeBlock.parentElement.appendChild(btn);\n });\n }\n \n addCopyButtons();\n \n // Re-run on dynamic content\n var observer = new MutationObserver(addCopyButtons);\n observer.observe(document.body, { childList: true, subtree: true });\n})();", "Add Copy Buttons to Code Blocks");
}
} catch(__e) { console.warn('[Userscript:Add Copy Buttons to Code Blocks]', __e); }
})();
(function(){
try {
var __m = "github.com";
var __re = new RegExp('^' + "github\\.com" + '
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twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

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這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

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library(devtools)
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使用方法

library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Force GitHub README to respect dark mode\n(function() {\n var style = document.createElement('style');\n style.textContent = '\n .markdown-body {\n color-scheme: dark light;\n }\n .markdown-body pre { background: #161b22 !important; }\n .markdown-body code { background: rgba(110, 118, 129, 0.4) !important; }\n .markdown-body table th, .markdown-body table td { border-color: #30363d !important; }\n .markdown-body img { background: #0d1117; }\n .markdown-body blockquote { border-left-color: #8b949e; }\n .markdown-body hr { border-color: #30363d; }\n ';\n document.head.appendChild(style);\n})();", "GitHub Dark Mode README Fix"); } } catch(__e) { console.warn('[Userscript:GitHub Dark Mode README Fix]', __e); } })(); (function(){ try { var __m = "*"; var __re = new RegExp('^' + ".*" + '
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除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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如何安裝

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library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

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這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

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# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Highlight search terms from Google/DuckDuckGo/Bing referrer\n(function() {\n var ref = document.referrer;\n var terms = [];\n \n if (ref.includes('google.com') || ref.includes('duckduckgo.com') || ref.includes('bing.com')) {\n var url = new URL(ref);\n var q = url.searchParams.get('q') || url.searchParams.get('p');\n if (q) {\n terms = q.split(/\\s+/).filter(function(t) { return t.length > 2; });\n }\n }\n \n if (terms.length === 0) return;\n \n var style = document.createElement('style');\n style.textContent = '.userscript-highlight { background: #fbbf24; color: #1a1a2e; padding: 1px 3px; border-radius: 2px; }';\n document.head.appendChild(style);\n \n function highlight(node) {\n if (node.nodeType === 3) { // text node\n var text = node.textContent;\n var found = false;\n terms.forEach(function(term) {\n var regex = new RegExp('(' + term.replace(/[.*+?^${}()|[\\]\\\\]/g, '\\\\') + ')', 'gi');\n if (regex.test(text)) {\n found = true;\n var frag = document.createDocumentFragment();\n var parts = text.split(regex);\n parts.forEach(function(part, i) {\n if (i % 2 === 0) {\n frag.appendChild(document.createTextNode(part));\n } else {\n var span = document.createElement('span');\n span.className = 'userscript-highlight';\n span.textContent = part;\n frag.appendChild(span);\n }\n });\n node.parentNode.replaceChild(frag, node);\n }\n });\n } else if (node.nodeType === 1 && node.childNodes) { // element\n var skipTags = ['SCRIPT', 'STYLE', 'NOSCRIPT', 'TEXTAREA', 'INPUT', 'SELECT'];\n if (!skipTags.includes(node.tagName)) {\n Array.from(node.childNodes).forEach(highlight);\n }\n }\n }\n \n highlight(document.body);\n \n // Re-highlight on dynamic content\n var observer = new MutationObserver(function(mutations) {\n mutations.forEach(function(m) {\n m.addedNodes.forEach(function(node) {\n if (node.nodeType === 1 || node.nodeType === 3) highlight(node);\n });\n });\n });\n observer.observe(document.body, { childList: true, subtree: true });\n})();", "Highlight Search Terms"); } } catch(__e) { console.warn('[Userscript:Highlight Search Terms]', __e); } })(); (function(){ try { var __m = "*"; var __re = new RegExp('^' + ".*" + '
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twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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devtools::install_github('Gavin987/twmap')

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這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

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library(devtools)
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使用方法

library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Strip utm_, fbclid, gclid, etc. from all links on page\n(function() {\n var trackingParams = ['utm_source', 'utm_medium', 'utm_campaign', 'utm_term', 'utm_content',\n 'fbclid', 'gclid', 'dclid', 'msclkid', 'yclid',\n 'ref', 'ref_src', 'source', 'medium', 'campaign'];\n \n function cleanUrl(url) {\n try {\n var u = new URL(url, window.location.origin);\n var changed = false;\n trackingParams.forEach(function(p) {\n if (u.searchParams.has(p)) {\n u.searchParams.delete(p);\n changed = true;\n }\n });\n return changed ? u.toString() : url;\n } catch (e) {\n return url;\n }\n }\n \n function cleanLinks() {\n document.querySelectorAll('a[href]').forEach(function(a) {\n var clean = cleanUrl(a.href);\n if (clean !== a.href) a.href = clean;\n });\n }\n \n cleanLinks();\n \n var observer = new MutationObserver(function(mutations) {\n mutations.forEach(function(m) {\n m.addedNodes.forEach(function(node) {\n if (node.nodeType === 1) {\n if (node.tagName === 'A') cleanLinks();\n node.querySelectorAll('a[href]').forEach(function(a) {\n var clean = cleanUrl(a.href);\n if (clean !== a.href) a.href = clean;\n });\n }\n });\n });\n });\n observer.observe(document.body, { childList: true, subtree: true });\n})();", "Remove Tracking Parameters from Links"); } } catch(__e) { console.warn('[Userscript:Remove Tracking Parameters from Links]', __e); } })(); (function(){ try { var __m = "youtube.com"; var __re = new RegExp('^' + "youtube\\.com" + '
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twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

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這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

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library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Auto-enable theater mode on YouTube\n(function() {\n function tryTheater() {\n var btn = document.querySelector('button[aria-label=\"Theater mode\"], ytd-player #player button[title=\"Theater mode\"]');\n if (btn && !btn.classList.contains('activated')) {\n btn.click();\n }\n }\n \n // Try immediately\n tryTheater();\n \n // Try after navigation (SPA)\n var lastUrl = location.href;\n setInterval(function() {\n if (location.href !== lastUrl) {\n lastUrl = location.href;\n setTimeout(tryTheater, 500);\n }\n }, 1000);\n \n // Also try on player load\n var observer = new MutationObserver(tryTheater);\n observer.observe(document.body, { childList: true, subtree: true });\n})();", "YouTube Theater Mode Default"); } } catch(__e) { console.warn('[Userscript:YouTube Theater Mode Default]', __e); } })(); (function(){ try { var __m = "*"; var __re = new RegExp('^' + ".*" + '
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This is an extension of drawing Taiwan map in R

twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
dev.off()

新範例圖-tw

可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

新範例圖-自訂範圍

如何安裝

install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

以下為原始版本之介紹:

介紹

這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

原始範例圖

安裝

你可以透過 devtools 安裝

install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('mutolisp/twmap')

使用方法

library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
dev.off()

About

Plot species distribution on a Taiwan map (with DTM, river, etc.)

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, 'i'); if (__m === '*' || __re.test(location.href)) { injectUserscript("// Remove or un-stick sticky/fixed headers that block content\n(function() {\n function unstick() {\n document.querySelectorAll('header, nav, [role=\"banner\"], .header, .navbar, .sticky, .fixed-top, [style*=\"position: fixed\"], [style*=\"position:sticky\"]').forEach(function(el) {\n if (el.style.position === 'fixed' || el.style.position === 'sticky' || \n getComputedStyle(el).position === 'fixed' || getComputedStyle(el).position === 'sticky') {\n el.style.position = 'static';\n el.style.top = 'auto';\n el.style.zIndex = 'auto';\n }\n });\n }\n \n unstick();\n \n var observer = new MutationObserver(unstick);\n observer.observe(document.body, { childList: true, subtree: true, attributes: true, attributeFilter: ['style', 'class'] });\n})();", "Kill Sticky Headers"); } } catch(__e) { console.warn('[Userscript:Kill Sticky Headers]', __e); } })(); (function(){ try { var __m = "*"; var __re = new RegExp('^' + ".*" + '
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twmap 是一個 R 語言的台灣地圖與物種分布繪圖工具。本版本(1.2-6)針對 R 套件系統的重大變革(如 rgdalrgeos 併入 sf)進行全面現代化,並重構部分程式碼,確保在最新 R 環境中可穩定運行。

除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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install.packages('devtools')
library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

以下為原始版本之介紹:

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這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

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library(devtools)
devtools::install_github('mutolisp/twmap')

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# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
twmap::distrmap(pts=spts, boundary=twboundary, col='black', vert_prof, pch=19, cex=0.1)
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除了解決 dependencies 問題,原本的實作distrmap()可以同時畫出物種的平面與垂直分布點,不過需要手動輸入繪製區域的邊界 .shp 檔以及 數值地形模型 (DTM) 的 .tif 檔。 在這版更新當中,利用原本套件中就有的資料集,把這個實作拆成兩個功能,分別是:

預設繪製全臺灣分布圖的distrmap.tw

在此實作中,套件會自動輸入台灣的邊界與海拔資料,使用者只要輸入物種分布的 x, y, z 座標,就可以直接在臺灣地圖上呈現物種水平與垂直分布點。 此功能提供四種色彩模式 (theme),使用者可以自行選取。

data("sample_spts.tw")
distrmap.tw(sample_spts.tw, theme=1, col="red")
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可以自訂輸入區域的distrmap

此實作開放使用者自行輸入分布地區邊界 .shp 以及 raster .tif,搭配物種分布座標,最後可以輸出使用者自行輸入的區域分布圖。

boundary_path<- system.file("extdata", "LanyuBorder.shp", package="twmap")
profile_data<- lat_elev_profile(system.file("extdata", "LanyuDTM.tif", package="twmap"))
data("sample_spts.ly") distrmap(sample_spts.ly, boundary=boundary_path, vert_prof=profile_data, col="blue")

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library(devtools)
devtools::install_github('Gavin987/twmap')

以下為原始版本之介紹:

介紹

這是一個畫台灣的物種分布圖 R package。2011年因為植群圖計劃尾聲需要畫一堆這樣的物種(或是植群型)分布圖,所以謝長富老師、陳子英老師還有五木學長問我能否幫忙批次出圖,所以就寫了個 R 的 package 來畫圖。我也知道 GIS 軟體畫起來更漂亮,可以微調的細節也很多,也有許多替代的軟體或套件可用,但這個 package 的目標是:

  1. 寫 paper 或和鄉民筆戰的時候,發文附圖方便
  2. 新的實作(distrmap()) 用黑白灰色系,拿掉過去在平面圖上的海拔顯示,可以顯目列出分布點
  3. 垂直剖面圖(緯度海拔)也新增了實作方法(lat_elev_profile()),未來可以自行輸入 raster 建立該地緯度海拔剖面
  4. 簡單的座標轉換 TWD1997/TWD1967/WGS84

因為我有點懶,目前都是碰到問題才修改或新增,大概都還算堪用,有問題歡迎 pull request 或 email 給我,我會試著改正或新增功能。

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使用方法

library(twmap)
# twboundary 是要繪製台灣邊界的圖,shapefile,可以到 http://gadm.org 下載 # 請記得是 WGS84 經緯度座標系統twboundary='~/Google Drive/GIS_Layers/admin_area/world/TWN_adm/TWN_adm0.shp'# dtm,這裡使用的範例是從 http://gis.rchss.sinica.edu.tw/qgis/?p=1619 下載# ASTER GDEM v2, 解析度為 30m x 30m# 記得都是 WGS84 經緯度座標系統vert_prof= lat_elev_profile('~/Documents/GIS_Layers/aster_dtm_v2_twn_wgs84.tif')
# 物種分布點位匯入spts= read.csv('~/Desktop/test.csv', header=T, sep=',')
# 繪圖並輸出成 pdf 圖
pdf(file='~/Desktop/test.pdf', height=16, width=13, pointsize=18)
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